Op 10 oktober 2004 heeft de Stichting St. Plechelmus 1050 de parochie als jubileumgeschenk een koororgel cadeau gegeven. Dit in verband met de feestelijkheden rondom het feit dat 1050 jaar geleden door bisschop Balderik in Oldenzaal een nieuwe kerk aan St. Plechelmus werd gewijd.
Met het koororgel beschikt de tegenwoordige basiliek - net als in de Middeleeuwen - weer over twee orgels.
De wens bestond al langer om ook vóór in de basiliek over een orgel te kunnen beschikken om de mogelijkheden voor koren tijdens de liturgie groter te maken. Een koor kan dan vlakbij het liturgisch centrum - het altaar - worden opgesteld.
Ook is een koororgel een verrijking voor de concertpraktijk. Het instrument is op het priesterkoor geplaatst. Het werd in 1980 gemaakt door B.A.G. Orgelmakers te Enschede en heeft één manuaal en een vrij pedaal.
